J Comput Biol: новий метод передбачення цілі противірусних препаратів або вакцин

Новий метод прогнозування найбільш перспективних противірусних препаратів або вакцинних мішеней заснований на конформаційних змінах, які зазнали вірусні глікопротеїни під час розпізнавання та зв'язування з клітинами господаря. Цей метод прогнозування спрямований на водневий зв’язок основного ланцюга з найвищим мотивом вільної енергії. Пов'язані результати досліджень опубліковані в журналі обчислювальної біології, який є рецензованим журналом, опублікованим Мері Енн Ліберт.

Роберт Пеннер - голова Рене Тома з Французького інституту вищої освіти (Bures-sur-Yvette) та математичної біології UCLA. Він є автором цієї статті під назвою" Оцінювач вільної енергії на основі хребта, застосований до вірусних глікопротеїнів&";

Джерело зображення: видавництва Mary Ann Liebert, Inc.

Коли вірус потрапляє в клітину хазяїна і поглинається, вірус зазвичай проходить енергійну рекомбінацію, утворюючи мотив злиття / інфільтрації. Пеннер запропонував загальний метод прогнозування висококонформаційно активних залишків з тривимірної структури вірусних глікопротеїнів. Метод включає аналіз водневих зв’язків білка та обчислення вільних енергетичних різниць відповідних ознак для визначення областей, де найімовірніше відбудеться конформаційна зміна. Запропонований у цій роботі метод в даний час застосовується для шипового глікопротеїну SARS CoV-2, який може спричинити COVID-19.

Міша Громов з Інституту прогресивної науки та Нью-Йоркського університету сказав:" Математична ідея безпосередньо призводить до практичного значення, що просто диво, але нагорода величезна, оскільки вона відбувається в Maxwell' теорія електромагнітного поля - це приносить радіо і телебачення, відкриваючи двері до теоретичних розрахунків у нашому цифровому світі." Він відомий математик та лауреат премії Абеля (також відомий як Нобелівська премія з математики)." Тільки тоді, коли її автор є видатним математиком, але також має широкий науковий горизонт, таке уявлення можливе, і це рідко серед кращих математиків сучасності. Роберт Пеннер - такий рідкісний математик, він виявив, що метод структури структури білка відрізняється від усіх інших у світі, а структура білкової структури - результат чистого математичного мислення. Цей метод, ймовірно, відіграє певну роль і прискорить розробку антивірусних препаратів або вакцин. Але лише експерименти можуть це довести." (Bioon.com)

джерело: